1. 直接用途

脂肪酸的兩個特點：潤滑性較好、溶解性較好。利用這兩個特點，脂肪酸甲酯可以直接用做某些產品的組分：比如用作潤滑方面的基礎油，用作溶劑（農藥...）、清洗劑（金屬清洗、脫漆...），做成無甘油的醇胺類產品,在洗滌等行業用途很廣。在這些領域中，脂肪酸甲酯與表面活性劑復配制備特定的清洗劑，可能是一個比較好的應用方向。還有脂肪酸甲酯經過磺化后可以得到甲酯磺酸鹽,在洗滌方面是一個非常優異的主洗劑,并且生物性能非常好。

2. 間接用途——主要是用作表面活性劑原料

脂肪酸甲酯經過進一步的化學反應，生產一些產品。高碳醇是一個比較好的方向，另外一個是脂肪酸甲酯α磺酸鹽，是一種好的陰離子表面活性劑。 

表面活性劑：從脂肪酸甲酯出發可生產兩大類表面活性劑，一類是通過磺化中和生產脂肪酸甲酯磺酸鹽(MES)，另一類是通過加氫生產脂肪醇。全世界脂肪醇的57%是由脂肪酸甲酯生產的，43%由脂肪酸生產。脂肪醇經乙氧基化生產醇醚(AE)、AE經磺化 中和生產醇醚硫酸鹽(AES)。也可將脂肪醇經磺化、中和生產伯烷基硫酸鹽(PAS)。因此，脂肪酸甲酯是MES、AE、AES和PAS等SAA的原料和中間體。油脂、脂肪醇、脂肪酸甲酯等原料的供應決定了上述生產SAA的效率。

脂肪酸甲酯可進一步轉化為其它酯、酯氨、酯磺酸鹽和高碳脂肪酸等。其重要作用有：

⑴在皮化行業用作生產皮革甲酯劑，也可以生產磺化琥珀酸脂肪酰胺酯二鈉鹽，是一種很有前途的紡織洗滌劑。

⑵將其加氫可制備高碳脂肪醇，而高碳脂肪醇是日用化妝品、香料等生產上不可缺少的原料之一，也是生產增塑劑、洗滌劑和表面活性劑（MES），MES是采礦的浮選劑。

⑶將其皂化、酸化后，還原成混合脂肪酸，供制皂制漆用項目指標